{"id":318,"date":"2016-09-06T16:01:51","date_gmt":"2016-09-06T15:01:51","guid":{"rendered":"http:\/\/blog.creamontblanc.org\/?p=318"},"modified":"2022-11-09T16:22:40","modified_gmt":"2022-11-09T15:22:40","slug":"analyses-de-sol-la-genetique-au-service-de-lecologie","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/blog.creamontblanc.org?p=318","title":{"rendered":"Analyses de sol : la g\u00e9n\u00e9tique au service de l\u2019\u00e9cologie"},"content":{"rendered":"

Ce mardi, l\u2019Observatoire du Mont-Blanc est le si\u00e8ge d\u2019analyses g\u00e9n\u00e9tiques de sol \u00e0 Loriaz. Une journ\u00e9e de pr\u00e9l\u00e8vement d\u2019\u00e9chantillons sur le terrain, suivie de plusieurs mois d\u2019analyses, contribuera \u00e0 la r\u00e9alisation d\u2019un catalogue des esp\u00e8ces et caract\u00e9ristiques des sols des Alpes afin d\u2019observer leurs \u00e9volutions face \u00e0 l\u2019homme et au climat.<\/strong><\/p>\n

\"Analyses<\/a>
Analyses g\u00e9n\u00e9tiques des \u00e9chantillons de sol par Ludovic Gielly (LECA Grenoble) \u00a9 CREA Mont-Blanc<\/em><\/figcaption><\/figure>\n

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\u00c0 l\u2019interface entre soci\u00e9t\u00e9 et environnement, l\u2019Observatoire des Relations Climat-Homme-milieux Agrosylvopastoraux du Massif alpin (ORCHAMP) est un dispositif d\u2019observation du socio-\u00e9cosyst\u00e8me sur le tr\u00e8s long terme\u00a0: l\u2019impact du climat et de l\u2019univers socio-\u00e9conomique sur l\u2019\u00e9cologie dans les Alpes. Le CREA Mont-Blanc a particip\u00e9 \u00e0 l\u2019\u00e9laboration de plusieurs protocoles scientifiques du programme et est un partenaire local pour l\u2019\u00e9tude du gradient d\u2019altitude de Loriaz.<\/p>\n

La g\u00e9n\u00e9tique au service de l\u2019\u00e9cologie<\/strong><\/p>\n

Neuf chercheurs, doctorants et ing\u00e9nieurs de l\u2019\u00e9quipe du Laboratoire d\u2019\u00c9cologie Alpine (LECA) de Grenoble, porteur du projet ORCHAMP, r\u00e9alisent les premi\u00e8res \u00e9tudes g\u00e9n\u00e9tiques de terrain depuis le d\u00e9but de la semaine.<\/p>\n

Aujourd\u2019hui au CREA Mont-Blanc, c\u2019est le gradient d\u2019altitude de Loriaz qui est pass\u00e9 au crible. Sur 1000 m de d\u00e9nivel\u00e9, on pr\u00e9l\u00e8ve tous les 200 m des \u00e9chantillons de sol qui sont ramen\u00e9s \u00e0 l\u2019Observatoire du Mont-Blanc. L\u2019ADN est imm\u00e9diatement isol\u00e9.<\/p>\n

Une premi\u00e8re \u00e9tape<\/strong><\/p>\n

L\u2019ADN pr\u00e9lev\u00e9 directement sur le terrain \u00e0 l\u2019Observatoire du Mont-Blanc repr\u00e9sente la premi\u00e8re \u00e9tape du travail de recherche sur les \u00e9chantillons de sol. Les \u00e9tapes suivantes auront lieu au Laboratoire d\u2019\u00c9cologie Alpine \u00e0 Grenoble. L\u2019ADN extrait sera amplifi\u00e9 et s\u00e9quenc\u00e9. Les esp\u00e8ces seront identifi\u00e9es en comparant les r\u00e9sultats avec les bases de donn\u00e9es pr\u00e9\u00e9tablies au moyen d’outils bio-informatiques.<\/p>\n

On recherche dans les \u00e9chantillons de l\u2019ADN d\u2019insectes, de microfaune, de collemboles (crustac\u00e9s microscopiques), de bact\u00e9ries, arch\u00e9bact\u00e9ries, champignons etc. On se sert aussi de ces \u00e9chantillons de sol pour mesurer des param\u00e8tres physico-chimiques\u00a0: quantit\u00e9 de carbone, d\u2019azote, pH, mati\u00e8re organique, activit\u00e9 enzymatique\u2026 Ces \u00e9l\u00e9ments serviront \u00e0 expliquer la pr\u00e9sence et l\u2019abondance de faune et de flore dans les diff\u00e9rentes zones en fonction de l\u2019altitude par exemple. L\u2019ensemble des analyses durera plusieurs mois.<\/p>\n

Des recherches sur le tr\u00e8s long terme<\/strong><\/p>\n

Les pr\u00e9l\u00e8vements de terrain vont durer une dizaine de jours sur les diff\u00e9rents sites de l’Observatoire ORCHAMP \u00e0 travers les Alpes fran\u00e7aises. Tous les 5 ans, on r\u00e9alisera \u00e0 nouveau cet \u00e9chantillonnage pour analyser les changements et \u00e9volutions. Cinq \u00e0 sept sites d\u2019\u00e9tudes devraient \u00eatre ajout\u00e9s chaque ann\u00e9e pour aboutir au suivi de 25 sites et repr\u00e9senter ainsi une grande vari\u00e9t\u00e9 de climats et de types de sol.<\/p>\n

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R\u00e9daction : Charlotte Mader<\/p>\n

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Pour en savoir plus
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L’article Journ\u00e9e de terrain #1 ORCHAMP : analyses g\u00e9n\u00e9tiques<\/a><\/p>\n

La page du programme ORCHAMP<\/a> sur le site Internet du LECA<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Ce mardi, l\u2019Observatoire du Mont-Blanc est le si\u00e8ge d\u2019analyses g\u00e9n\u00e9tiques de sol \u00e0 Loriaz. Une journ\u00e9e de pr\u00e9l\u00e8vement d\u2019\u00e9chantillons sur le terrain, suivie de plusieurs mois d\u2019analyses, contribuera \u00e0 la r\u00e9alisation d\u2019un catalogue des esp\u00e8ces et caract\u00e9ristiques des sols des … Lire la suite\u00ad\u00ad<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":5,"featured_media":320,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_monsterinsights_skip_tracking":false,"_monsterinsights_sitenote_active":false,"_monsterinsights_sitenote_note":"","_monsterinsights_sitenote_category":0,"ngg_post_thumbnail":0,"footnotes":""},"categories":[194],"tags":[52,211],"class_list":["post-318","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-la-recherche","tag-orchamp","tag-sol-vivant"],"aioseo_notices":[],"amp_enabled":true,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/318","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/5"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=318"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/318\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":333,"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/318\/revisions\/333"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/320"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=318"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=318"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/blog.creamontblanc.org\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=318"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}